L’IBBL collabore avec l'Institut National du Cancer des États-Unis
IBBL vient de débuter une collaboration avec la branche de recherche sur les échantillons biologiques et les biobanques du prestigieux Institut National du Cancer américain. Dans le cadre de deux projets de recherche, les chercheurs visent à évaluer l’impact des variations pré-analytiques (la durée de fixation ou d’ischémie froide) sur la qualité des tissus de cancer, utilisés à la fois pour le diagnostic et la recherche. Le but est d’identifier les groupes de molécules les plus sensibles à ces variations et de valider l’usage de ces molécules comme outils de contrôle qualité pour les échantillons de tissus.
Les échantillons biologiques destinés à la recherche translationnelle et clinique doivent être bien annotés avec les données cliniques et des informations sur la façon dont ils ont été traités avant l’analyse. Autant que possible, toutes les étapes du parcours d’un échantillon biologique, de la collecte à l’analyse finale, doivent être étroitement contrôlées. C’est le rôle des biobanques à travers le monde. Pour identifier la meilleure façon de manipuler un échantillon donné, les scientifiques doivent d’abord déterminer l’influence des différents facteurs relatifs à la collecte, au traitement et au stockage sur les résultats finaux des analyses. L’impact potentiel de ces variations sur la qualité des échantillons amène IBBL à effectuer des recherches pré-analytiques. Ces dernières constituent un outil d’amélioration continue. C’est la raison pour laquelle l’Institut National du Cancer (National Cancer Institute – NCI) des États-Unis a mis en place une branche de recherche sur les échantillons biologiques et les biobanques (Biorepositories and Biospecimen Research Branch – BBRB). Celle-ci a pour mission de faciliter la recherche sur le cancer et la recherche biomédicale, en améliorant la qualité et la consistance des échantillons biologiques humains.
L’un des domaines clé de BBRB est le soutien et le développement de la recherche sur les échantillons biologiques, par exemple, en lançant des appels à projets collaboratifs. En 2013, IBBL a décidé de collaborer sur deux projets de recherche sur les variations pré-analytiques dans différents types de tissus de cancer. IBBL analysera les tissus cancéreux collectés par le NCI pour étudier des variations dans la collecte et le traitement, par exemple lorsque les tissus sont fixés dans le formol et enrobés de paraffine. Les deux projets sont menés par Dr Fay Betsou, Chief of Biospecimen Science d’IBBL.
Pour le premier projet, IBBL utilisera le système SmartChip Real-Time PCR de WaferGen, l’un des partenaires de la biobanque, pour comparer des molécules régulatrices, appelées micro-ARN (miARN), dans des tissus qui ont été fixés dans le formol pour différentes durées. Le projet vise à identifier quelles miARN peuvent ou ne peuvent pas être détectées en fonction du temps de fixation, et ainsi à évaluer quelle pourrait être l’utilité de certaines miARN comme biomarqueurs cliniquement pertinents.
Le deuxième projet utilisera les mêmes types de tissus cancéreux et évaluera comment l’activité des gènes évolue en fonction du temps qui passe entre le prélèvement du tissu et son traitement dans le laboratoire (temps d’ischémie froide). Plutôt que d’analyser des milliers de gènes, le projet se focalise sur des gènes cibles. Des études précédentes avaient déjà montré que ces gènes sont sensibles au temps d’ischémie froide, et sont donc de potentiels marqueurs de contrôle qualité.
«Bien que les activités de biobanque traditionnelles comme la collecte, le traitement et le stockage d’échantillons soient le fer de lance de notre fondation, la recherche pré-analytique sur les échantillons biologiques est un élément clé dans la réalisation de nos missions», commente Dr Catherine Larue, directrice générale d’IBBL. Evidemment ravie que la qualité de la recherche d’IBBL ait attiré l’attention d’organisations internationales prestigieuse telles que NCI, Dr Larue ajoute: «Ce sont l’expertise et l’expérience de notre personnel qui ont contribué à attirer des partenaires et des clients bien connus et respectés».
// Source photo: IBBL